我國(guó)發(fā)布荷斯坦牛中高密度基因組選擇育種芯片
新華社北京9月13日電(記者丁靜、張驍)一張全基因組育種芯片上均勻分布超12萬(wàn)個(gè)基因位點(diǎn),檢出率和檢測(cè)準(zhǔn)確率超99%,技術(shù)達(dá)國(guó)際先進(jìn)水平……12日在第三十屆中國(guó)北京種業(yè)大會(huì)上,荷斯坦牛中高密度基因組選擇育種芯片發(fā)布,標(biāo)志著我國(guó)荷斯坦牛中高密度育種芯片自主設(shè)計(jì)開(kāi)發(fā)取得重要突破。
荷斯坦牛是當(dāng)前世界奶牛的主要品種,作為單胎大型動(dòng)物,選擇出優(yōu)秀種公牛是奶牛育種的核心工作。
近年來(lái),國(guó)際上已進(jìn)入奶牛基因組選擇育種時(shí)代,使用中高密度育種芯片,能使種公牛培育周期由約6年縮短至約2年,育種效率顯著提升。
第三十屆中國(guó)北京種業(yè)大會(huì)上展出的荷斯坦牛中高密度基因組選擇育種芯片。新華社記者丁靜 攝
“十四五”國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目首席科學(xué)家、中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)教授孫東曉說(shuō),我國(guó)近年來(lái)加速構(gòu)建和優(yōu)化奶牛基因組選擇育種技術(shù)平臺(tái),但過(guò)去完全依賴國(guó)外育種芯片,國(guó)內(nèi)種牛檢測(cè)樣品需要送到國(guó)外實(shí)驗(yàn)室檢測(cè),存在技術(shù)“卡點(diǎn)”及生物信息安全風(fēng)險(xiǎn)。
2020年,首農(nóng)食品集團(tuán)北京奶牛中心、中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)、華智生物技術(shù)有限公司啟動(dòng)荷斯坦牛育種芯片自主開(kāi)發(fā)聯(lián)合攻關(guān),基于過(guò)去多年的科研成果,挖掘、鑒定了一批針對(duì)我國(guó)荷斯坦牛群體遺傳背景的基因位點(diǎn),自主設(shè)計(jì)了涵蓋超12萬(wàn)個(gè)位點(diǎn)(即126K)的育種芯片,可通過(guò)牛的毛發(fā)或血液等,檢出基因突變位點(diǎn)、遺傳缺陷位點(diǎn)、親子鑒定位點(diǎn)、其他多組學(xué)來(lái)源數(shù)據(jù)位點(diǎn)等。
近日,專家組論證認(rèn)為,芯片設(shè)計(jì)科學(xué)合理,驗(yàn)證程序完善,參照國(guó)際同類產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn),達(dá)到產(chǎn)業(yè)化推廣應(yīng)用水平,可用于荷斯坦牛基因組選擇參考群體的構(gòu)建及種牛評(píng)價(jià)。
“這是我國(guó)荷斯坦牛育種領(lǐng)域首款中高密度育種芯片,對(duì)提升我國(guó)種公牛自主培育能力和水平,進(jìn)一步完善奶牛種質(zhì)自主評(píng)價(jià)體系具有重要意義。”中國(guó)奶業(yè)協(xié)會(huì)副秘書(shū)長(zhǎng)陳紹祜說(shuō)。
中國(guó)奶業(yè)協(xié)會(huì)育種專業(yè)委員會(huì)主任麻柱說(shuō),奶牛育種自主創(chuàng)新聯(lián)盟將率先用上這款芯片,助力保障我國(guó)奶牛自主選育體系穩(wěn)定運(yùn)行,維護(hù)生物信息安全。
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